Ngày 8/7/1993, Phòng Vi sinh vật dầu mỏ, Viện công nghệ sinh học, Trung tâm Khoa học Tự nhiên và Công nghệ Quốc gia (nay là Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam) được thành lập theo quyết định 18/CNSH-QĐ. Tiền thân của phòng Vi sinh vật dầu mỏ hiện nay là phòng Vi sinh vật dầu mỏ, Trung tâm nghiên cứu vi sinh vật, Viện Khoa học Việt Nam (1/7/1990), mà trước đó là nhóm nghiên cứu thuộc phòng Công nghệ vi sinh, Viện Sinh vật học, Viện Khoa học Việt Nam.
Theo quyết định số 186/QĐ-CNSH ngày 6 tháng 04 năm 2023 Phòng Vi sinh vật dầu mỏ được Viện trưởng Viện công nghệ sinh học ban hành lại Quy định chức năng nhiệm vụ của phòng.
Lãnh đạo phòng qua các thời kỳ
7/1990 - 3/2006 | Trưởng phòng | PGS. TS. Lại Thúy Hiền |
4/2006 - 8/2007 | Phó trưởng phòng, phụ trách phòng | TS. Đặng Phương Nga |
10/2007- 9/2009 | Phó viện trưởng, phụ trách phòng | PGS. TS. Trần Đình Mấn |
10/2009 - 4/2013 | Trưởng phòng | TS. Nguyễn Thị Thu Huyền |
05/2013 đến nay | Trưởng phòng | TS. Kiều Thị Quỳnh Hoa |